1986年7月，成立清流縣檔案局，實行局館合署辦公，兩塊牌子，一套班子。檔案局既是縣委部門，又是政府機構(gòu)，歸政府直接領(lǐng)導(dǎo)。1997年機構(gòu)改革，為縣委直屬機構(gòu)。主要職能部門：1、辦公室：協(xié)助局、館領(lǐng)導(dǎo)處理日常行政事務(wù)，協(xié)調(diào)機關(guān)，內(nèi)部各股室工作；承擔(dān)局、館機關(guān)黨務(wù)、群團、效能建設(shè)工作，負責(zé)局、館人事、計劃生育和秘書、文電、檔案、信息、統(tǒng)計、信訪、安全保衛(wèi)、保密、行政后勤、檔案刊物發(fā)行及文件打印工作；負責(zé)全縣檔案干部教育、培訓(xùn)和檔案專業(yè)技術(shù)職務(wù)評聘的有關(guān)工作；負責(zé)本單位行政、事業(yè)經(jīng)費的管理和接待工作；負責(zé)離退休人員服務(wù)管理工作；負責(zé)檔案學(xué)會日常工作。2、監(jiān)督指導(dǎo)股：負責(zé)檢查監(jiān)督本縣各級、各部門和企事業(yè)單位宣傳貫徹執(zhí)行檔案法規(guī)、制度的情況；負責(zé)對本縣機關(guān)、團體、企事業(yè)單位的業(yè)務(wù)指導(dǎo)；監(jiān)督檢查指導(dǎo)全縣重點工程、國有資產(chǎn)、重要科技項目和新經(jīng)濟領(lǐng)域、新經(jīng)濟組織的建檔工作；負責(zé)全縣檔案事業(yè)發(fā)展中重要問題的調(diào)查研究，提出意見和建議。3、保管利用股：負責(zé)接收、征集檔案資料，對已進館的檔案資料進行鑒定、整理、統(tǒng)計、解密劃控工作，提出開放范圍；編制各類檢索工具，進行檔案著錄標(biāo)引；負責(zé)對保管期滿及無保存價值檔案的鑒定、銷毀工作；負責(zé)保管本縣單位檔案資料，負責(zé)檔案庫房管理，對館藏檔案進行檢查，掌握檔案保管情況，做好館藏檔案的防火、防蟲、防霉、防盜等八防工作；負責(zé)庫房溫濕度記錄、分析、調(diào)控，對破損、蟲蛀、字跡褪變檔案進行搶救修復(fù)。