南通市水利局負責貫徹落實中央關于水利工作的方針政策和省市委的決策部署，在履行職責過程中堅持和加強黨對水利工作的集中統(tǒng)一領導。其主要職責是：（一）貫徹執(zhí)行黨和國家有關水利方面的方針政策、法律法規(guī)以及省市決策部署并監(jiān)督實施。擬訂全市水利發(fā)展政策。組織起草全市有關地方性法規(guī)、規(guī)章草案。（二）負責保障水資源的合理開發(fā)利用。編制全市水資源規(guī)劃和區(qū)域水利綜合規(guī)劃、防洪規(guī)劃、水土保持規(guī)劃等水利規(guī)劃。編制全市水域及其岸線利用、主要河道治理和河口控制等專業(yè)（項）規(guī)劃。對有關國民經濟和社會發(fā)展規(guī)劃、城鄉(xiāng)總體規(guī)劃、國土空間規(guī)劃中的涉水內容提出意見建議，組織開展重大建設項目的水資源、防洪、水土保持論證評價工作。（三）負責生活、生產經營和生態(tài)環(huán)境用水的統(tǒng)籌和保障。組織實施最嚴格水資源管理制度，實施水資源的統(tǒng)一監(jiān)督管理，擬訂全市水中長期供求規(guī)劃、水量分配方案并監(jiān)督實施。負責重點水利工程的水資源調度。組織實施取水（含礦泉水、地熱水）許可、水資源論證制度，組織指導開展水資源有償使用工作。指導水利行業(yè)供水、排水和再生水利用工作。（四）負責水資源保護工作。組織編制并實施水資源保護規(guī)劃。指導飲用水水源保護有關工作，按規(guī)定組織飲用水源地設置論證工作。組織指導地下水開發(fā)利用和地下水資源管理保護。組織指導地下水超采區(qū)綜合治理。對主要河道和地下水實施監(jiān)測，發(fā)布水資源公報。按規(guī)定組織開展水資源調查評價和水資源承載能力監(jiān)測預警工作。（五）負責節(jié)約用水工作。擬訂節(jié)約用水政策，組織編制節(jié)約用水規(guī)劃、擬訂行業(yè)用水標準并監(jiān)督實施。組織實施用水總量控制等管理制度，指導和推動全市節(jié)水型社會建設工作。牽頭節(jié)水型城市創(chuàng)建工作。（六）組織指導水利固定資產投資計劃和資金監(jiān)督管理工作。負責市級水利建設資金的計劃、使用、管理及內部審計監(jiān)督。研究提出有關水利的價格、收費、信貸、財務等方面的意見。（七）組織實施重點水利工程建設和質量監(jiān)督。組織指導水利基礎設施網絡建設，組織指導具有控制性的和跨區(qū)域的重要水利工程建設。組織指導水利建設市場的監(jiān)督管理。編制、審查重點水利基本建設項目建議書和可行性報告。組織指導全市水利工程建設質量監(jiān)督工作。依法負責水利行業(yè)安全生產工作。（八）組織指導河道水域及其岸線的管理、保護與綜合利用。組織指導主要河道、水庫及河口的治理、開發(fā)和保護。組織指導河道水生態(tài)保護與修復、河道生態(tài)流量水量管理以及河道水系連通工作。（九）組織指導水利設施的管理與保護。組織編制水利工程運行調度規(guī)程，指導水庫、泵站、堤防、水閘等水利工程的運行管理與確權劃界。負責市屬水利工程的運行管理。（十）指導農村水利工作。組織開展大中型灌排工程建設與改造。指導農村飲水安全、鄉(xiāng)鎮(zhèn)供排水、農村河道疏浚整治等工程建設與管理工作，指導節(jié)水灌溉有關工作。指導農村水利改革創(chuàng)新和社會化服務體系建設。牽頭負責農村地區(qū)水環(huán)境治理工作，推進農村河道整治工作。（十一）組織指導水土保持工作。組織編制水土保持規(guī)劃并監(jiān)督實施，指導水土流失綜合防治、監(jiān)測預報并定期公告。指導生產建設項目水土保持監(jiān)督管理工作。指導市重點水土保持建設項目的實施。（十二）負責水旱災害防御及水量調度工作。組織編制洪水干旱災害防治規(guī)劃和防護標準并指導實施。承擔水情旱情監(jiān)測研判預警工作。組織編制主要河道和重要水工程的防御洪水抗御旱災調度及應急水量調度方案，按程序報批并組織實施。承擔防御洪水應急搶險的技術支撐工作。承擔臺風防御期間重要水工程調度工作。（十三）指導三峽移民工作。貫徹落實三峽移民有關政策，指導監(jiān)督三峽移民后期扶持政策的實施。（十四）組織水利科學技術研究和推廣。組織指導全市水利行業(yè)技術標準、規(guī)程規(guī)范的實施。組織指導水利信息化和水利行業(yè)對外合作與交流工作。（十五）負責重大涉水違法事件的查處，協(xié)調和仲裁跨縣（市）區(qū)的水事矛盾糾紛。組織指導水利行政許可、水政監(jiān)察、水行政執(zhí)法和普法宣傳工作。負責全市河道采砂的統(tǒng)一管理和監(jiān)督檢查。（十六）承擔市河長制工作領導小組的日常工作。（十七）完成市委、市政府交辦的其他任務。