南通市民族宗教事務局，為市政府工作部門。其主要職責是：（一）貫徹執(zhí)行黨和國家有關民族宗教工作的方針政策和法律法規(guī)，負責民族宗教政策、法律、法規(guī)的宣傳教育，組織開展民族宗教理論、政策和民族宗教工作的調查研究，并提出相關政策建議，協(xié)調推動有關部門履行民族宗教工作相關職責。（二）依法保障少數(shù)民族公民合法權益，會同有關部門處理因少數(shù)民族問題引起的突發(fā)事件，及時化解矛盾，維護民族宗教領域安全穩(wěn)定。（三）開展全市民族團結進步創(chuàng)建活動，加強社區(qū)少數(shù)民族工作，協(xié)同有關部門加強對少數(shù)民族流動經商人員的服務和管理，協(xié)助有關部門做好少數(shù)民族干部的培養(yǎng)、教育和使用等工作。（四）協(xié)同有關部門做好少數(shù)民族扶貧工作，指導少數(shù)民族扶貧生產基地建設，推動落實國家對少數(shù)民族特需商品生產企業(yè)的有關優(yōu)惠政策，協(xié)助有關部門加強對生產銷售清真食品單位的扶持和管理，審核發(fā)放“清真”標志牌。（五）協(xié)調、指導市少數(shù)民族聯(lián)誼會的工作，加強其思想、組織建設，發(fā)揮聯(lián)誼會的橋梁、紐帶作用。加強與民族學校的工作聯(lián)系。（六）依法履行宗教事務管理工作，依法保障公民宗教信仰自由，保護正常的宗教活動，維護宗教團體、宗教活動場所和信教公民的合法權益，指導全市民族宗教事務部門依法履行管理職責，協(xié)調處理民族宗教事務的重大事項，防范利用宗教進行的非法、違法活動，抵御境外利用宗教進行的滲透活動。（七）指導宗教團體依法依章開展活動，支持宗教團體加強自身建設，推動宗教團體開展愛國主義、社會主義、擁護祖國統(tǒng)一和民族團結的自我教育，辦理宗教團體需有政府解決或協(xié)調的有關事務。（八）負責宗教方面的外事歸口管理工作，組織指導全市民族宗教事務部門和宗教界開展對外以及對港澳臺的宗教交往活動。（九）承辦市政府交辦的其他事項。