南通市市檔案局，為市委、市政府直屬正處級事業(yè)機構(gòu)，市檔案館與市檔案局一個機構(gòu)兩塊牌子。其主要職責是：（一）貫徹執(zhí)行黨和國家檔案工作的方針、政策和法規(guī)，制定檔案行政管理制度、工作規(guī)則、業(yè)務(wù)規(guī)范，組織、指導、檢查和監(jiān)督《檔案法》的實施。（二）對全市檔案事業(yè)實行統(tǒng)籌規(guī)劃，制定全市檔案事業(yè)發(fā)展規(guī)劃和工作計劃，并組織實施。組織、指導、檢查市屬機關(guān)、團體、企事業(yè)單位和各縣（市）區(qū)的檔案管理工作及新的社會經(jīng)濟組織、重點工程等領(lǐng)域的檔案工作。（三）負責全市檔案事業(yè)發(fā)展的調(diào)查研究，解決檔案工作中的有關(guān)業(yè)務(wù)問題，推進全市檔案工作標準化、規(guī)范化、制度化、科學化建設(shè)，負責全市檔案事業(yè)統(tǒng)計年報工作。（四）制定全市檔案工作隊伍建設(shè)規(guī)劃，組織檔案專業(yè)教育和檔案專業(yè)干部培訓工作。負責全市檔案專業(yè)技術(shù)職務(wù)評審的有關(guān)工作。（五）組織檔案管理行政執(zhí)法檢查，依法查處違法案件，加強法制化建設(shè)，保證依法治檔工作落實。（六）組織檔案的利用、編研、宣傳、出版工作，有計劃地公布檔案史料，組織開展檔案史料陳列展覽等教育活動，向社會提供廣泛的服務(wù)。（七）集中統(tǒng)一管理市委、市人大、市政府、市政協(xié)、市紀委及市級各機關(guān)、單位的重要檔案和歷史、社會檔案資料，做好各類檔案的接收、整理、保管、鑒定、劃控、統(tǒng)計等項工作，保守黨和國家機密，維護檔案的完整與安全，組織開展檔案資源整合和館藏檔案結(jié)構(gòu)改善工作。（八）負責向全社會征集散失在有關(guān)組織或公民個人手中的具有保存和利用價值的檔案資料，收集散失在國外的有關(guān)南通的檔案文件和歷史資料。（九）組織實施檔案技術(shù)保護工作。（十）指導市檔案學會開展日常工作，開展檔案學理論和檔案管理現(xiàn)代化的研究，組織多種形式的學術(shù)交流活動。（十一）負責全市黨政機關(guān)現(xiàn)行文件的收集、整理并向社會提供利用，參與《中華人民共和國政府信息公開條例》貫徹實施的組織指導、檢查工作。（十二）承辦市委、市政府交辦的其他工作。