交通運輸部長江航務(wù)管理局（以下簡稱長航局）是遵照國務(wù)院國發(fā)[1983]50號文件精神，根據(jù)政企分開、港航分管的原則，在原長江航運管理局的基礎(chǔ)上于1984年組建的。2002年，中編辦《關(guān)于交通部長江航務(wù)管理局主要職責和人員編制的批復》（中編辦復字[2002]7號）明確長航局為交通部派出機構(gòu)，受交通部委托或法規(guī)授權(quán)行使長江干線（四川宜賓——上海長江口，干線航道里程2808公里）航運發(fā)展規(guī)劃、運輸市場監(jiān)管、水上安全監(jiān)督、航道整治維護、三峽樞紐通航、水上治安消防等政府行業(yè)管理職能。2009年，隨國家大部制改革，經(jīng)國務(wù)院批準定名為交通運輸部長江航務(wù)管理局。2016年，交通運輸部領(lǐng)導實施深化長江航運管理體制改革，長江干線海事、航道實現(xiàn)了集中統(tǒng)一管理。目前，長航局下轄長江海事局（含江蘇海事局）、長江航道局（含長江口航道管理局）、長江三峽通航管理局、中國水運報刊社和長航總醫(yī)院等11個單位，還有66個基層局，遍布長江沿線大中城市，全系統(tǒng)現(xiàn)有職工3.5萬余人。長航局主要職責：（一）貫徹國家水路交通行業(yè)發(fā)展戰(zhàn)略、方針政策和法規(guī)，組織或參與長江干線航運有關(guān)規(guī)章草案的擬定工作，按法定程序批準后負責監(jiān)督實施；擬定長江干線航運發(fā)展戰(zhàn)略，組織編制長江干線航運中長期規(guī)劃和五年規(guī)劃，報交通運輸部批準后監(jiān)督實施。（二）負責長江干線航運行政管理。負責長江干線航運市場宏觀調(diào)控和秩序監(jiān)督管理；規(guī)范長江干線水運建設(shè)市場，維護平等競爭秩序；負責長江干線港航設(shè)施建設(shè)和使用岸線布局的行業(yè)管理；組織長江干線國家重點物資和緊急物資運輸；協(xié)助軍事物資運輸；負責長江干線水運規(guī)費稽征。（三）負責長江干線客貨運輸質(zhì)量、航運基礎(chǔ)設(shè)施工程項目和水運工程質(zhì)量的監(jiān)督管理。（四）負責長江干線航道、樞紐通航、通信、引航等管理工作。（五）按規(guī)定管理長江干線水上安全監(jiān)督和航運公安工作。（六）協(xié)調(diào)長江水系各省（市）交通運輸廳（局、委）及其航務(wù)管理機構(gòu)、港口管理機構(gòu)的相關(guān)業(yè)務(wù)工作；協(xié)調(diào)長江水系水資源綜合開發(fā)中的有關(guān)航運工作。（七）指導長江干線水運行業(yè)體制改革、法制建設(shè)和結(jié)構(gòu)調(diào)整；組織航運重大科技開發(fā)、推動行業(yè)技術(shù)進步；負責長江干線水運行業(yè)相關(guān)的統(tǒng)計和信息引導；負責政府間長江干線航運涉外工作，指導利用外資工作；開展國際間內(nèi)河運輸經(jīng)濟技術(shù)合作與交流；指導長江干線航運信息化和職工教育工作。（八）負責局機關(guān)和系統(tǒng)單位的年度固定資產(chǎn)投資計劃、財務(wù)管理和審計監(jiān)督工作。（九）負責局機關(guān)和系統(tǒng)單位人事、勞動工資、機構(gòu)編制管理工作；按規(guī)定管理系統(tǒng)單位領(lǐng)導干部；負責系統(tǒng)單位黨的建設(shè)、廉政建設(shè)和思想政治工作，指導長江干線水運行業(yè)精神文明建設(shè)和職工隊伍建設(shè)工作。（十）承辦交通運輸部交辦的其他事項。