舟山市小干島商務區(qū)開發(fā)建設指揮部是由市住建局（規(guī)劃局）管理的副縣處級事業(yè)單位，主要負責小干島商務區(qū)開發(fā)建設工作。主要職責如下：(一)貫徹落實新區(qū)黨工委、管委會和市委、市政府關于加快推進小干島商務區(qū)開發(fā)建設、促進舟山群島新區(qū)建設的部署和要求，全面組織實施小干島商務區(qū)開發(fā)建設工作。（二）負責組織編制小干島商務區(qū)開發(fā)建設相關規(guī)劃和圍墾方案、城市設計方案。（三）負責工程項目的論證、設計、申報、確定運作模式和招投標等重大事項；負責工程項目施工過程中的質(zhì)量和安全監(jiān)管。（四）負責擬訂區(qū)域內(nèi)土地征用、房屋征收及補償政策，處理開發(fā)建設中的重大政策問題。（五）負責商務區(qū)項目招商引資工作，為開發(fā)和入駐企業(yè)在項目洽談、立項、簽約、落地等過程提供全方位服務，協(xié)調(diào)處理投資過程中的有關訴求；負責管理小干島商務區(qū)建設控股有限公司的投資、融資工作。（六）承辦新區(qū)黨工委、管委會和市委、市政府及市住建局（規(guī)劃局）交辦的其他事項。