福建省水利廳主要職責：統(tǒng)一管理全省水資源（含空中水、地表水、地下水）。組織擬定全省和跨市（地）水中長期供求計劃、水量分配方案并監(jiān)督實施；組織有關國民經濟總體規(guī)劃、城市規(guī)劃及重大建設項目的水資源和防洪的論證工作；組織實施取水許可制度和水資源費征收制度；發(fā)布全省水資源公報；負責管理全省水文工作。擬定節(jié)約用水政策，編制節(jié)約用水規(guī)劃，制定有關標準，組織、指導和監(jiān)督全省節(jié)約用水工作。按照國家和省有關資源與環(huán)境保護的法律、法規(guī)和標準，擬定水資源保護規(guī)劃；組織水功能區(qū)的劃分和向飲水區(qū)等水域排污的控制；監(jiān)測江河湖庫的水量、水質，審定水域納污能力；提出限制排污總量的意見。組織、指導水政監(jiān)察和水行政執(zhí)法；協(xié)調并仲裁部門間和市（地）間的水事糾紛。擬定水利行業(yè)的經濟調節(jié)措施；對水利資金的使用進行宏觀調節(jié)；指導水利行業(yè)的供水、水電及多種經營工作；研究提出有關水利的價格、稅收、信貸、財務等經濟調節(jié)意見。編制、審查綜合利用的大中型水利工程的項目建議書、可行性研究報告和初步設計文件，并按國家規(guī)定的基本建設程序辦理審批手續(xù)；組織重大水利科學研究和技術推廣；組織實施水利行業(yè)技術質量標準和水利工程的規(guī)程、規(guī)范并監(jiān)督實施。組織、指導全省水利設施、水域及其岸線的管理與保護；組織指導主要江河、河口的治理和開發(fā)，負責海岸灘涂的圍墾工作和海堤建設與管理工作；辦理跨省河流協(xié)調事務；在職責范圍內對全省水利建設工程進行管理。組織建設、指導和管理具有控制性的或跨市（地）的重要水利工程；組織、指導水庫、電站大壩的安全監(jiān)管。指導農村水利工作；組織協(xié)調農田水利基本建設，指導鄉(xiāng)鎮(zhèn)供水和農村節(jié)水工作。組織全省水土保持工作。研究制定水土保持的工程措施規(guī)劃，組織水土流失的監(jiān)測和綜合防治。指導全省水利隊伍的建設；負責全省水利方面的科技和外經、外事工作。指導全省水利行業(yè)的水電工作，組織協(xié)調農村水電電氣化工作。承擔福建省人民政府防汛抗旱指揮部的日常工作，組織、協(xié)調、監(jiān)督、指導全省防洪工作，對主要江河和重要水利水電工程實施防汛抗旱調度。承辦省政府交辦的其他事項。